Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms