Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 490 ms