Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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