Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNSO60931 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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