Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB2O43679 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB2O43679 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB2O43679 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDB2O43679 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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