Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNMO15061 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNMO15061 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms