Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF103O00237 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF103O00237 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms