Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGPD3A6NKT7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms