Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms