Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144AA2RUR9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms