Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARP1Q9Y4F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms