Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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HCN4Q9Y3Q4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HCN4Q9Y3Q4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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