Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q9Y3F1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms