Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
YBX2Q9Y2T7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YBX2Q9Y2T7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms