Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms