Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHKBQ9Y259 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKBQ9Y259 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms