Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCA2Q9UQC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA2Q9UQC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA2Q9UQC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms