Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFR2Q9UP52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.56
TFR2Q9UP52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFR2Q9UP52 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms