Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF19Q9UMS4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF19Q9UMS4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms