Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD4Q9ULV1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD4Q9ULV1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD4Q9ULV1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms