Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA3Q9UL41 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms