Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXL4Q9UKA2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXL4Q9UKA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXL4Q9UKA2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms