Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEFF2Q9UIK5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms