Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCF2Q9UG63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCF2Q9UG63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCF2Q9UG63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms