Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A2Q9UBY0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A2Q9UBY0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A2Q9UBY0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms