Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNG4Q9UBN1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNG4Q9UBN1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms