Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMC3IPQ9P2W1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMC3IPQ9P2W1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms