Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FRMD4AQ9P2Q2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms