Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC48.43■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC48.41■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC48.39■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC48.38■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.38■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC48.37■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC48.36■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC48.36■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC48.36■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.35■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC48.32■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.32■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC48.32■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC48.32■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC48.31■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC48.31■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.31■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC48.28■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC48.27■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC48.26■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC48.25■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.32
CCDC180Q9P1Z9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC48.25■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC48.25■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.2■■■■■ 5.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms