Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC59Q9P031 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms