Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMCD1Q9NZU5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMCD1Q9NZU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms