Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD3Q9NZN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EHD3Q9NZN3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms