Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf78Q9NZ63 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms