Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA3Q9NZ52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGA3Q9NZ52 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms