Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN6Q9NWW5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN6Q9NWW5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms