Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM140Q9NV12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms