Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GINM1Q9NU53 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms