Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF275Q9NSD4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF275Q9NSD4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms