Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf17Q9NRJ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf17Q9NRJ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms