Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SH2B1Q9NRF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH2B1Q9NRF2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms