Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST12Q9NRB3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms