Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR8Q9NR97 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR8Q9NR97 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR8Q9NR97 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms