Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF3Q9NR81 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms