Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms