Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BIN3Q9NQY0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms