Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCUBE2Q9NQ36 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE2Q9NQ36 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCUBE2Q9NQ36 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE2Q9NQ36 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms