Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASCL3Q9NQ33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms