Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPCPD1Q9NPB8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPCPD1Q9NPB8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms