Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KIAA1549Q9HCM3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms