Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC3Q9HBV1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC3Q9HBV1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms